Jean-François Vallée enseigne les littératures québécoise et française au niveau collégial depuis 1995. Depuis 2013, il enseigne aussi le journalisme et le cinéma québécois au sein du programme Arts, lettres et communication, option Médias au Cégep de La Pocatière. Auparavant, il a enseigné à Québec au cégep de Sainte-Foy et au cégep Champlain St-Lawrence.